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Analyse

NGS TUM

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Accréditation iso 15189

OUI

Réalisé en urgence

Non précisé

Secteur concerné

Biologie Moléculaire

Biologiste responsable

Dr. H. Paridaens

Numéro de téléphone

18157

Code Laboratoire

NGSTUM

Intérêt clinique

Intérêt clinique

Diagnostic et suivi thérapeutique oncologiques

Etude somatique des variants présents dans les gènes suivants:



AKT1, ALK1, BRAF, CTNNB1, EGFR, ERBB2, ERBB3, ESR1, FOXL2, GNA11, GNAQ, IDH1, IDH2, KIT, KRAS, MET, NRAS, PDGFRA, PIK3CA, RAF1, RET, TP53

Pré-analytique

Matériel de prélèvement

OU tissu fixé, parafiné et enrobé (LAMES 4-5 µm) ,Tube de sang Cell-free DNA (STRECK)

Volume minimum à prélever

10 µL

Prélèvements adultes

photo materiel photo materiel

Prélèvements pédiatriques

Non précisé

Commentaire prélèvements

Prélèvement de biopsie avec paraffine:

1) Lames:
4 lames sont préparées par le service d'anatomo-pathologie suivant leur procédure interne.
Ces lames sont coupées si possible à 5µ et conservées entre 15 - 30°C pendant 90 jours.
- 1 lame témoin : colorée à l'hématoxyline ce qui permet de déterminer le pourcentage de cellules tumorales. Cette lame témoin
est ensuite analysée pour identifier la zone tumorale à traiter et conservée par le service d'anatomo-pathologie.
Si cette lame n'est pas présente, l'indication du pourcentage d'infiltration par les cellules tumorales doit être indiquée sur la feuille de prescription.
- 3 lames échantillon à tester.
Remarque: La quantité de lames peut varier en fonction du nombre de tests demandés.


2) Paraffine en tube
Trois tubes tous étiquetés au nom du patient sont nécessaires pour la réalisation des analyses.

En général: pour un séquençage NGS un minimum de 3 copeaux/lames blanches (idéalement 5) est requis.

Commentaire prescripteur

Le prescripteur peut utiliser une demande spécifique aux analyses oncologiques (lien hypertexte FESECR-0057) ou une demande (lien hypertexte FE- SECR-0012) pour les biopsies liquides en spécifiant les différentes analyses demandées.
Cependant, les demandes des autres hôpitaux peuvent aussi convenir tant qu'elles contiennent toutes les informations à la fois pour le patient (Nom, prénom, date de naissance, adresse, infos mutuelle (mieux: vignette de mutuelle) et le médecin (nom, prénom, adresse, lieu de consultation (si différent de l'adresse), N°INAMI, date, signature) ainsi que les différentes analyses demandées et l'indication clinique, le diagnostic anatomopathologique et le stade de la maladie si possible.

Quand prélever

Non précisé

Lien vers la demande d'analyse spécifique

Non précisé

Commentaire Tri

Biopsie liquide :
Le tube Cell-Free DNA BCT CE Streck vide est stable jusqu'à la date de péremption s'il est conservé entre 15 et 30C°.
Une fois le prélèvement effectué, celui-ci reste stable durant 10 jours s'il est conservé à température ambiante soit entre 15 et 30°C pour l'ADN acellulaire.

Paraffine :
L'échantillon de paraffine en tube ou sur une lame est conservé à température ambiante dans le bac de réception d'échantillon ou le bac Idylla à faire. Le prélèvement
doit être apporté au labo endéans les 90 jours (=durée de « vie » de l'échantillon).

Analytique

Méthode utilisée

Séquençage de haut débit

Unité

µL

Intervalles de référence

Non précisé

Délai de réalisation (jour)

15

Post-analytique

Délai d'ajout

Non précisé

Nomenclature



Libellé

Non précisé

Code inami

Non précisé

Nombre de B

Non précisé

Prix

Non précisé

Divers

Non précisé

Règle

Non précisé

Classe

Non précisé

Règle diagnostique

Article 33ter

Règle de cumul

Non précisé

Références scientifiques

Non précisé





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